獲中華民國斐陶斐榮譽學會第21屆傑出成就獎(2016)
入圍中央研究院第31屆院士正式成為院士候選人第二名(2016)
獲國立中興大學農業暨自然資源學院103年度學術論文發表總篇數全院第一名(2015)
研發有機碳再利用之環保產品「大勇肥」正式上架(2014)
國立中興大學榮譽講座教授(2014)
國立中興大學中興講座(2014)
國立中興大學生命科學院第一屆傑出校友(2014)
入圍中央研究院第30屆院士正式成為院士候選人 (2014)
獲國立中興大學農業暨自然資源學院102年度學術論文發表總篇數全院第一名 (2014)
獲選為農業生物技術產業化發展方案計畫之「典範案例」(2013)
國立中興大學第16屆傑出校友 (2012)
獲國科會99年度獎勵特殊優秀人才措施之獎勵（2011）
國立中興大學中興講座(2011)
國立中興大學產學合作技術移轉傑出獎(2011)
ICSU國際環境問題科學委員會SCOPE-ZHONGYU首屆環境終生成就獎(2010)
國立中興大學農藝學系系友會第十二屆傑出系友(2010)
國立中興大學98年度建教合作研究計畫績優獎(2010)
國立中興大學30年資深優良教師獎(2010)
教育部「終生榮譽國家講座」(2009)
經濟部工業局Crazy Idea應用王-生物技術研發成果創意應用競賽 佳作獎兩項(2009)
台中市特殊優良教師獎(2009)
國科會50周年舉辦「50科學成就」，研究成果獲選為50大重要科學之一(2009)
農業生物技術國家型科技計畫十年綻放光芒「榮耀生技」獎(2009)
國科會97年度技術移轉個案獎(2008)
美國夏威夷大學熱帶農業及人力資源學院(CTAHR)首位特聘訪問學者(2008)
經濟部工業局Crazy Idea應用王-生物技術研發成果創意應用競賽銀牌獎及佳作獎兩項(2008)
國立中興大學建教合作研究績優獎(2008)
教育部「國家講座」(2005)        中華土壤肥料學會「學會獎」(2006)
國立中興大學講座教授 (2005)     國立中興大學建教合作研究績優獎(2007)
國立中興大學建教績優獎(2005)    國立中興大學建教合作研究績優獎(2006)
國立中興大學建教合作研究績優獎(2008)
國立中興大學生命科學系傑出系友(2006)
國立成功大學環境研究中心第二屆國際環境生物復育科技榮譽獎(2005)
行政院傑出科技榮譽獎(2004)  
國立中興大學研究傑出獎(2004)
行政院國科會傑出特約研究員獎(2003)
教育部「學術獎」(1999)
國立中興大學傑出研究教師獎(1999)
國科會特約研究人員(1996至2002)
國科會「傑出研究獎」（連續五次)(1985,1987,1989,1991,1993)
中華農學會「農業學術獎」(1994)
中華土壤肥料學會「學術論文獎」
教育部「特優教師獎」(1994)
教育部「優秀教育人員獎」(1992)
中國農業化學會「學術榮譽獎」(1990)
國際斐陶斐榮譽學會會員(1987)
美國東西文化中心團隊獎(Team Award)

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